¿Cuándo es necesario el reanálisis genético?
El reanálisis de los resultados de pruebas genómicas debería considerarse en varias situaciones clave:
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- Evolución del Conocimiento Genético: A medida que se descubren nuevas relaciones gen- enfermedad y se mejoran los algoritmos de predicción de patogenicidad, es esencial reevaluar las variantes previamente clasificadas. Esto puede llevar a reclasificaciones significativas que impacten el manejo clínico.
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- Cambios en el Fenotipo del Paciente: El fenotipo de un individuo puede evolucionar con el tiempo, presentando características relevantes que no estaban presentes o reconocidas en el momento de la clasificación inicial de la variante.
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- Solicitudes Externas: Tanto los equipos clínicos como los pacientes pueden solicitar reevaluaciones, especialmente si hay cambios en la presentación clínica del paciente o nueva información familiar disponible.
¿Cómo se debe realizar la reevaluación?
La ACMG proporciona una guía detallada sobre los procedimientos para la reevaluación y el reanálisis:
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- Reevaluación de Nivel de Variante: Involucra la investigación y posible reclasificación de variantes previamente reportadas. Esta puede ser iniciada a pedido externo o de manera sistemática por el laboratorio, especialmente cuando se detectan variantes previamente reportadas en un nuevo caso.
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- Reanálisis de Nivel de Caso: Involucra la revisión de todas las variantes en un exoma o genoma, tanto reportadas como no reportadas. Este proceso puede incluir el reprocesamiento completo de los datos mediante nuevas herramientas bioinformáticas si se han producido avances significativos.
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- Actualización de Informes: Los laboratorios deben tener políticas para la emisión de informes actualizados cuando hay cambios significativos en la clasificación de variantes, priorizando aquellos que afecten el manejo clínico.
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- Documentación y Transparencia: Es fundamental mantener una base de datos actualizada de variantes clasificadas y compartir clasificaciones y reclasificaciones en bases de datos públicas como ClinVar (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/), acompañadas de un resumen de la evidencia que respalda cada clasificación.
Frecuencia del Reanálisis Genético
Según la declaración del ACMG, se recomienda realizar un reanálisis genético aproximadamente cada 2 a 3 años, aunque esto puede variar dependiendo del avance en el conocimiento genético y las circunstancias específicas de cada caso. Esta recomendación se basa en la rápida evolución del campo y la necesidad de mantener la información genética actualizada para la toma de decisiones clínicas.
Conclusión
La reevaluación y el reanálisis de datos genómicos son esenciales para mejorar la precisión diagnóstica y la gestión clínica en genética médica. Las políticas y protocolos deben actualizarse constantemente para reflejar nuevos desarrollos en bases de datos poblacionales, curación genómica, bioinformática y registros electrónicos de salud.
Referencia: Points to consider in the reevaluation and reanalysis of genomic test results: a statement of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). DOI: https://doi.org/10.1038/s41436-019-0478-1.